校长办公室、五台校区管理办公室

教务部（教务处、研究生院、医学教育研究所、教学管理处）

人事处、人才工作办公室

学科建设与发展规划处

科研院

学生工作部（学生工作处、学问艺术教育中心）

医院发展管理处、临床提升战略办公室

保卫处

信息化建设与管理处

审计处

财务处

资产与产业管理处、实验室与设备管理办公室

后勤管理处、后勤服务集团

国际合作与交流处、港澳台办公室

基建与工程管理处

常州校区管理委员会